农村有一院并持有房本，这新院子能办理房产证

新院子能否办房产证需视情况而定。分析：在农村地区，拥有房本意味着对原有院落的合法所有权。若再建新院子，需符合当地土地利用规划和建房审批流程。若未经批准擅自建设，可能面临违建风险，影响房产证的办理。提醒：若新院子建设后长时间无法获得房产证，或收到相关部门违建通知，表明问题可能比较严重，应及时咨询专业人士。
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具体操作：1.若新院子建设合法，但手续不全，应尽快向当地土地和规划部门提交建房审批申请，补全手续后，可申请房产证。2.若新院子被认定为违建，但情节较轻，可尝试与相关部门沟通，了解补办手续的可能性，并缴纳相应罚款。3.若违建情节严重，面临拆除风险，应咨询律师了解法律救济途径，如申请行政复议或提起行政诉讼，同时考虑与相关部门协商，寻求减少损失的解决方案。在整个过程中，保持与相关部门的沟通，确保行动合法合规。
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处理方式：从法律角度看，处理新院子房产证问题主要有两种方式：一是补办建房审批手续，确保建设合法；二是若已被认定为违建，可了解拆除、罚款或补办手续等处理方案。选择建议：若新院子建设初期，应尽快补办审批手续；若已建成且被认定为违建，需根据具体情况选择最佳处理方案，权衡利弊。